U skladu s Planom reakreditacije, u svibnju 2016. godine započela je reakreditacija poslijediplomskih sveučilišnih (doktorskih) studijskih programa.
Cilj je reakreditacije doktorskih studijskih programa prvenstveno osigurati da visokoobrazovne kvalifikacije uz naslov doktora i doktorice znanosti odražavaju kvalitetne studijske programe, međunarodno usporedive i cijenjene. Osim provjere uvjeta propisanih zakonom, reakreditacija uključuje vanjsku procjenu kvalitete međunarodno uglednih stručnjaka, iskusnih u osiguravanju kvalitete na doktorskoj razini i prepoznatih po njihovoj istraživačkoj izvrsnosti te donošenje preporuka za svaki pojedinačni program.
Tijekom 2016. i 2017. godine planirano je vrednovanje svih doktorskih studija u Hrvatskoj, a ove će godine postupak proći studiji iz tehničkog, biotehničkog, prirodnog te biomedicinskog i zdravstvenog područja.
U svibnju i lipnju 2016. godine, stručna su povjerenstva posjetila sljedeća visoka učilišta:
- Fakultet strojarstva i brodogradnje Sveučilišta u Zagrebu
- Fakultet prometnih znanosti Sveučilišta u Zagrebu
- Strojarski fakultet Sveučilišta J. J. Strossmayera u Osijeku (Slavonski Brod)
- Tehnički fakultet Sveučilišta u Rijeci
- Pomorski fakultet Sveučilišta u Rijeci
- Građevinski fakultet Sveučilišta J. J. Strossmayera u Osijeku
- Fakultet građevinarstva Sveučilišta u Rijeci
- Arhitektonski fakultet Sveučilišta u Zagrebu
- Geodetski fakultet Sveučilišta u Zagrebu
- Građevinski fakultetu Sveučilišta u Zagrebu
- Fakultet građevinarstva, arhitekture i geodezije Sveučilišta u Splitu
- Agronomski fakultet Sveučilišta u Zagrebu
- Prehrambeno-biotehnološki fakultet Sveučilišta u Zagrebu
- Grafički fakultet Sveučilišta u Zagrebu
- Šumarski fakultet Sveučilišta u Zagrebu
- Poljoprivredni fakultet Sveučilišta J. J. Strossmayera u Osijeku
- Prehrambeno-tehnološki fakultet Sveučilišta J. J. Strossmayera u Osijeku
- Tekstilno-tehnološki fakultet Sveučilišta u Zagrebu.